通过了一节短暂的通道和一段台阶之后，众人来到了一个地下空间，这里堆满了各种箱子，箱子上都有安布雷拉的伞标志，还有一些大的油桶，很明显这里就是一个货物中转站。
一进入蜂巢，林风感觉有一股气息往身上冲，原来是t病毒已经扩散开来，这一股气息无声无息，所以安保人员的医官检查不出来，可是林风是何人，他得肉体，已经锻炼到可以闭住毛细孔，只是林风才不会这么作，要知道t病毒，也是一种锻炼肉身的好办法。
很快，所有安保人员，都中了t病毒，只是因为t病毒是扩散在空气之中，所以症状不明显，t病毒的初期感染症状，就跟一般的小病症没什么差别，只不过是咳嗽、打喷嚏，或是像起疹子般的发痒，由于这就像是人体在过敏或接受刺激时，所产生类似发炎的反应，所以平常根本没有人会去注意这种事，顶多以为自己感冒了，就去药房买保护伞公司的感冒药来吃。
可是就算是保护伞公司自己开发出来的感冒药，也无法杀死这种猛烈的t病毒（除非注射抗病毒抗体），在患者去买感冒药的同时，病毒早就在宿主尚未发觉的情形下，开始侵害感染者的细胞组织了。
在电影中，t病毒能使死亡的细胞复活。哪怕那个躯体是一只手或一只脚，这表明t病毒进入并控制?被感染的每一个细胞。但在病毒简介里却说重创丧尸的头部能致使僵丧尸死亡，既然是控制每一个细胞，为什么单单打击头部就能杀死t病毒呢？这表明t病毒并不是单单病毒，而是类似寄生控制体的有意识生物。
其实丧尸的大脑虽然已被t病毒腐蚀，但是大脑仍有一部分（此时t病毒仍在腐蚀大脑）在控制?生物的本能——心脏跳动、血液循环、消化系统、听力、嗅觉以及残留的智力。由于头部被t病毒腐蚀，所以变得脆弱不堪，此时只要一枪或一脚就能摧毁剩馀的大脑，生物就没有听力、嗅觉、智力了。若不攻击其大脑，几个小时后也会因为大脑被完全腐蚀而死。
至于第二期的症状，就跟t病毒本身的功能有关了。前面已经提到过，t病毒最明显的功能，就是“加速生物体内的新陈代谢”，换句话说，只要一个生物被t病毒所感染，它本身的新陈代谢速度就会迅速地增快，而人类当然也在这个生物范畴之内。
第三期的症状就显得较为严重了。因为病毒已经开始侵蚀大脑部分的细胞，使患者的智能低下；不只是智能，连大脑里专司理性、感情的部分，也渐渐被腐蚀。
此外，因为之前发生过度的新陈代谢，所以本体需要很多能量，来弥补新陈代谢所消耗的大量能源，偏偏能量又只能从外界摄取，这些生物的食欲就大为昂进，只要看到、听到、闻到生物的存在，立刻会冲过来追杀被他所盯上的猎物，这就是所谓的“狂暴化”。
有个资料叫做“饲养日志”，那个职员原本是很正常的，然而就在感染了t病毒之后，写的东西跟举动竟变得一天比一天奇怪，最后甚至还杀了自己的同事，然后将之吃掉。这里要提示一下，阿克雷山区的杀人事件并非由这些需要能量的丧尸所造成。
第四期症状就是“丧尸”这个形态的末期症状。此时丧尸全身的皮下组织已经开始腐烂，发出了所谓丧尸特有的“恶臭”。此外，动作开始变得迟钝，除了脑部极少数的感觉部门，以及延脑的生命维持中枢仍然正常运作之外，其它部分几乎完全遭到破坏而腐烂，换句话说就是“只剩下自律神经系统存在著，其馀的部分早已完全消失了”。
此时这个人已不具有理智，只晓得动物的本能：“求取猎物”。尽管头盖骨的大小跟正常人没有两样，但里面简直是空的，所以有时候主角只要开一枪，就能把他们的头整个打爆，甚至还可以一脚就把僵尸的头踩碎，如果是正常的人头，根本就不会这么脆弱。
然而，也就是因为大脑几乎全被破坏，所以他们的痛觉可说是完全消失了，即使用枪打他们，也不会觉得痛，因而能够在不断中枪的情况下，继续朝玩家所操控的主角走近。还有就是虽然视觉逐渐消失，但为了找寻猎物，嗅觉与听觉变得十分灵敏，只要主角一靠近，他马上会察觉您的存在，接?下一步就是袭击过来
有人可能会觉得奇怪：“那些被袭击的人们，难道完全不会反抗吗？为什么乖乖的给僵尸们咬、给他们吃？”然而，这边就要说明一个生物现象了。
人类在平常，之所以无法发挥百分之百的力气去做事，是因为心理上会存在著一个恐惧：“怕伤害到自己”。
简单举个例：今天叫您面对一个石头或柱子全力挥拳，您一定不会真的“全力”去做的，因为反作用力的关系，自己的手也会受到相等力量所造成的伤害，所以人在这种时候都会保留部分的力量，以免伤害自身。
然而，这些感染到t病毒，甚至已经进入末期症状的僵尸们，是不可能考虑到这件事的。前面已经说过，他们大脑里控制理智及情绪的部分已经完全遭到破坏，换句话说，不管是什么事，他们都会真正的“全力”去做！当一群人真正“全力”上来围捕您时，如果手上没有武器，真的可以说是必死无疑，因为力量相差太多了。
大多数t病毒感染的丧尸因为满足不了摄取食物的欲望而会发生腐烂，散发恶臭，脑容量为零，并且全身骨头因为负担过重而产生脆化，最终不是倒在街头，就是被一枪毙命。
当被t病毒感染的丧尸有了充足的养分供应时候，它就会发生进化，变成一种叫“舔食者（licker）”的猎杀怪物。它们皮肤虽然会慢慢脱落，但肌肉??会迅速成长，变得非常发达。脑细胞死亡现象不再发生，取而代之的是头盖骨的消失，将发达的脑部暴露在外，视觉虽然消失，但听觉异常发达。
由于脑部结构依然比较完整。因此，舔食者在遭受攻击时也会感觉到痛，正因如此，舔食者在中枪之后会停顿。但由于本身肉体强健以及t病毒带来的创口快速恢复功能，舔食者会在短时间内迅速爬起，继续对目标进行攻击。
另外，舔食者所拥有的长长利爪以及锐利的舌头，也是导致警员突围行动失败的罪魁祸首。然而，在浣熊市地下的安布雷拉伞公司研究所（蜂巢）中，会发现一种双手已经变为“镰刀”的深褐色舔食者，很难想象它们如果有充足的养分，会进化成什么样子。
所以现在安保人员已经有了初期的症状，每个人的免疫系统，已经开始杀死外来的病毒，连林风也不例外，只是林风的细胞更是强大，已经开始在吞噬t病毒了，所以林风不会感染，就是这个道理，要知道，肉体越强的人，越是不怕病毒的感染，反而会吞噬病毒，来壮大自己。
在这些的另一面，几根柱子的另一面，就是一辆电轨列车，这里也是一个站台，这些特别小队非常谨慎的做著防御动作，毕竟蜂巢突然失去联系，他们不能够确定状况，这里会不会有敌人他们都不清楚。
搜索完这里，并没有任何的敌人之后，詹姆士带著所有人上了电车，同时抬上来两个大箱子，这是对付红后用的。
电车并没有通电，所以法启动，女突击队员蕾恩下去修理，其实就是几个插头断开和电轨没有结合，当处理好一切之后，电车里面重新被照亮，同时电车中间的挡板也闭合。
蕾恩下去修理的时候，发现铁丝网已经被咬破，这是因为红后可以封锁住蜂巢，却封锁不住这些地下生物，如老鼠、蟑螂之类的，所以其实，生化危机已经感染全部浣熊市，只是暂时是在动物之间传染，毕竟没人会去吃老鼠、蟑螂的吧，当然，除了一些流浪猫之类的，可是这也很少，因为浣熊市的流浪猫全部都在动物之家中，有现成吃的东西，怎么会想去吃老鼠呢。
在电车行进的时候，蕾恩了一个闭合的铁门，她想打开可是闭合的太紧，孙阳，里面的家伙就是引发这次事故，也是引发末日的史宾斯。
等到门打开之后，史宾斯瘫软的从里面倒在地上，爱丽丝看到他的样子，就这是另外一个守卫，也就是的假丈夫，因为林风事前说过了，所以她没有别的感受，很平静的看著史宾斯。
林风心里感觉史宾斯真是够蠢的，没有事先安排好一切，没有逃出蜂巢，反倒昏倒了，又被带了回去，也是他命已该绝。
到达蜂巢的站台之后，这里的灯一盏接一盏的亮起来，把黑洞洞的站台照亮，突击小队的成员立刻下车占据了站台所有有利位置，但是他们这些动作在林风看来，简直是不堪一击，可以在他们的射击圈里跳舞。
当然，林风不是白痴的去这么说出来，而是和另外一名突击队员一起下了电车，找一个位置躲起来等著突击队部署好之后再继续前进。
这里通往蜂巢的大门是封闭的，突击小队直接用暴力手段打开了那扇足有十多厘米厚的大铁门，里面漆黑一片，两名突击队员立刻带上夜视镜进入其中，可是刚进去几步，里面就亮起灯来，而在另外一边，詹姆士也给爱丽丝解释了一下蜂巢和爱丽丝的身份，和林风讲的一样，爱丽丝这次放下心来。
等到里面已经被侦查了一遍，林风他们也都进入其中，在一面墙壁上，用屏幕模拟出外边的高楼大厦，这是为了防止在蜂巢里工作和生活的研究人员在地下过于压抑而设计的，在蜂巢内，可是有几百名研究人员居住和工作，当然，也有一部分和林风这样，在地面上居住，每天下来上班。
强行拉开电梯门，电梯已经被红后给整残了，失去了使用的作用，詹姆士只能够下令走楼梯，林风觉得自己好像来到了无限恐怖之中，这可是新人的第一道鬼门关，但是林风实在是搞不懂，就这么点楼梯，大概四五层楼的楼梯，居然能够成为新人的鬼门关，真不知道里那两个挂在这里的龙套有多渣。
轻松的下到楼梯底层，这里已经进入到了试验区域，在通道的两边，都是钢化玻璃围成的实验室，不过现在这些实验室里都是灌满了水，一些被消防斧砸开的小洞像是喷泉一样往外把水排出来。
“林风研究员，这是什么情况”
看到这里的情况，詹姆士把林风叫过来问道。
“这应该是红后做的，因为整个蜂巢的系统都是红后在控制，这些实验室的门都被封死，除了红后没有人能够做到这一点，而且没有火灾，消防阀是不可能打开的，除了被红后激活，我就是搞不懂，红后为什么要这么做，难道被病毒入侵了吗”
林风是知道原因的，但是还是一本正经的鬼扯，反正这些人也不知道这里是什么情况。
“这里的人是都被红后给杀了吗”
爱丽丝不可思议的看著这里狼藉的景象，所有人都没有注意到麦特眼睛里已经开始充满血丝，同时青筋暴起，如果不是双手被手铐绑著，他恐怕早就冲过来了。
“红后是谁为什么要把这里所有的人都给杀了。”
麦特咬牙切齿的问道。
“红后是这里的控制系统，是人工智能，如果没有病毒入侵，它做的每一步都是符合逻辑的，也就是说，它杀光这里的人肯定有一个理由。”
林风给麦特解释一下，孙阳知道，麦克肯定是因为自己妹妹的原因，想要给妹妹报仇，可惜他不知道的是红后不是人，只是一个程序。
说话间，突然一名突击队员叫了一声，从靠著实验室的位置弹跳到一边，众人立刻看过去，估计队员的枪口也瞄准了那里，结果发现，只是一具死尸漂浮到了玻璃旁，大家才松了口气继续前进。
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