昆仑，天下龙脉之源，万山之祖。亦是天下灵气最为充沛之处。昆仑古时为西王母居所，其间异兽奇木数不胜数。后为凡人所识，于是三两一群，聚居于此，希望能借此地之灵气，修习仙法，期待日后能羽化飞升。
后逐渐各自形成门派，其修炼之法，各有所长。繁盛之时，大小门派竟有上百之多。奈何时过千年，虽时常有人修出惊世修为，但前后近百万人竟然无一人修得仙体。
昆仑群山之中，一小派出一奇才，此人十岁便将自家门派精髓全数习得，修为更是远超昆仑山中的其他修道之人。后昆仑其他门派见其天赋异禀，便各自将派内千年积累尽数相送。没想到，又是仅仅十年，此人便将昆仑各派法诀仙术修集一身，且修为远超各派先辈，虽未施术，却威势逼人，极近仙人。各派见此，便萌生合各派之所长，建一大派之意。
于是此人受各派推举，任新派掌门，新门派与昆仑山同名，名曰昆仑。新派建立，新派掌门有感于派内修炼之法过于庞杂，不利于昆仑弟子修炼，便将掌门之位交予他人，独自入昆仑群峰深处闭关，希望能创出新法。
再是一个十年，终于创出新法，且此人修为更是精进。出关之时面容未曾老去，但鬓发雪白，虽威势更盛，但人人见之倍感亲近。昆仑长者们见了，知道前掌门已经修得仙体，顿时喜极而泣。后昆仑弟子依照新法修炼，修为突飞猛进，使得昆仑实力飞涨，远超天下各派。天下各派便以昆仑为尊，尊此人为仙长。避其名讳，称昆仑仙长。
昆仑仙长有感于，昆仑虽然就此昌盛，但凡间百姓生活依然疾苦。便化身凡人，入凡间以解救天下百姓。
后在凡间解救了一女子，昆仑仙人见其天资聪颖，便收其为徒，授其修道之法，并让女子跟随左右，两人一同扶济天下。谁料两人渐生情愫，女子表明心迹后，遭昆仑仙人断然拒绝。女子心灰意冷，便入了一邪教，成为邪教护法。昆仑仙人也回到昆仑，但无法放下心中之爱，便再入昆仑深处修炼，以期能修得无欲无求。
后不知何故，昆仑仙人因何而再入深山被那女子所知，那女子便闯入昆仑，要与昆仑仙人双宿双飞，见昆仑仙人不曾露面，便对其大肆辱骂，嘲笑其不愿面对心中真实之自我。昆仑弟子见此女子为邪教护法，且所作所为有辱于昆仑仙人，便与女子打斗起来。奈何此女子为昆仑仙人亲手所教，修为远胜于其他人。昆仑上下竟无一人可以与其一较高下。最后昆仑掌门以剩余阳寿祭出昆仑至宝——昆仑镜，将此女子毙于镜下。
昆仑仙人本可提前感知，却因情爱之事而乱了心神。竟未能察觉。后昆仑仙人自觉有愧，但女子已入邪道，正邪不两立，且人之生死，实乃天数，便未追究他人杀生之罪。又自成仙以来便感应到仙人寿命虽长，但依然有限，且仙人之上，该有更高境界。于是离开昆仑，寻求修炼之法，希望能突破现有境界。
离开之时定下门规，昆仑要以守护天下苍生为第一要务，且弟子有了一定修为之后要入凡间，阅历凡间之事，方可再次入昆仑继续修习仙法。此后，世人遵照昆仑仙人修炼之法以寻求仙道，却奈何仙境难至，两千年来修得仙体者不过一双之数。且都是习集天下门派之精髓，非一派弟子。至此昆仑虽依旧为正道之首，但威望远不如昆仑仙人还在昆仑之时。
昆仑威望日渐消弱。在昆仑众人欲重振声威却一筹莫展之时，昆仑弟子中有三人横空出世，年仅三十修为便欲达仙人之境，这让昆仑众人想起了昆仑仙人，看到了昆仑声威重振的希望。
后三人遵照昆仑门规，下山历练，因行屡次行侠仗义，被世人称为昆仑三侠，三侠为玄字辈，是为玄清，玄明，玄朗。
就在众人以为三侠经历人间之事后，便可重回昆仑修炼成仙，昆仑派无论实力还是声威都得以重回巅峰之时，三侠之一玄朗却困于凡间情爱之事，弃修仙之道。最后又莫名死去。又有玄明与邪教教主之女有染，最后脱离正道，进入邪教。昆仑掌门自觉没能管教好弟子，愧对于昆仑先祖，竟气极而亡。
此时之昆仑，老一辈之中，仅有已故掌门实力出众，其余皆是修为平平之人，而年轻一辈弟子中，仅有昆仑三侠修为绝伦。昆仑掌门仙逝之后，放眼昆仑上下，却无一人能带领整个门派。三侠之首玄清便放弃修得仙体之愿，执掌昆仑。何曾想，自玄清接位掌门以来，或是修炼得当，或是时机已到，昆仑年轻弟子修为日渐精进，其中以弟子玄真，玄玉修为最是了得。到如今，昆仑实力和声望虽无望重回创派之初始，但也让觊觎昆仑之地者，心有畏惧。
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